В августе 1993 года отделом образования г. Кургана была создана городская психолого-медико-педагогическая консультация. Заведующей ПМПК была назначена Рябцева Софья Вельковна. Консультация располагалась в каб. № 8 здания Инновационно-методического центра по адресу ул. Гоголя, 103-А. Задачами ПМПК были: обследование детей от 0 до 18 пет на наличие специальных образовательных условий, комплектование и  формирование специальных логопедических групп в детских садах города, групп для детей с ЗПР (ДОУ №  34) и коррекционных классов в школах, школе 52 класс с нарушением зрения (начиная с 1-го класса).  В состав комиссии входил: заведующая, два учителя-дефектолога (Снегирёва Наталия Яковлевна, Кравчук Ирина Александровна), педагог-психолог (Дубровина Галина Викторовна), врачи-психиатры (Ховрина Людмила Владимировна, Волкова Варвара Ивановна, Бережнёва Елена Васильевна). В то время в Кургане насчитывалось 199 коррекционных классов. Их называли «маленькие классы». В СОШ №№ 36, 39, 44, 5 с 1 по 9 класс в каждой параллели было по одному коррекционному классу. Обучающиеся с умственной отсталостью обследование на установление специальных образовательных условий проходили в Центральной ПМПК.

В то время ПМПК вела активное совместное сотрудничество с ЦПМПК, с образовательными организациями, с психоневрологической больницей.  ПМПК проводили ряд семинаров для учителей и педагогов, работающих с детьми с ОВЗ. С 2014 года  заведующей Городской  психолого-медико-педагогической комиссии  стала Волкова Светлана Дмитриевна. С 2016 года  возглавила Бажан Галина Сергеевна. К тому времени было введено название Территориальная психолого-медико-педагогическая комиссия.